Sông Salzach là sông chính ở bang Salzburg của Áo. Nguồn nằm ở rìa dãy Kitzbühel Alps gần Krimml ở khu vực phía tây Pinzgau. Đầu nguồn của nó làm mất nhiều đồng cỏ Alpine ở độ cao trên mực nước biển khoảng 2.300 m (7,500 ft), giữa Krimml và ranh giới của bang Tyrol, cách bắc Gerlos Pass 3–5 km về phía dốc của Salzachgeier (2.466 m trên mực nước biển)) và đỉnh Schwebenkopf gần đó (2.354 m).

Từ đây, nó chạy theo hướng đông qua một thung lũng lớn qua Bruck phía Nam của Hồ Zell đến Schwarzach im Pongau. Rẽ về phía bắc, đi qua Sankt Johann im Pongau, chảy giữa dãy núi Berchtesgaden Alps và dãy núi Tennen đến Hallein và thành phố Salzburg.

Từ ngã ba với chi lưu Saalach ở lưu vực phía bắc Salzburg, Salzach tạo thành biên giới giữa Bavaria, Đức và các bang Áo Salzburg và Upper Áo trong gần 70 km (43 dặm). Các thành phố trên các ngân hàng ở phần dưới này bao gồm Laufen và thị trấn Oberndorf bei Salzburg, Tittmoning, và Burghausen. Tất cả những thị trấn này đều có biên giới.

Sông cuối cùng đã kết hợp Iưu ở Haiming giữa Burghausen và Braunau.